Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP2Q96HF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms