Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF2Q96GP6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms