Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD4

AURKB, Aurora kinase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKBQ96GD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AURKBQ96GD4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AURKBQ96GD4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AURKBQ96GD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms