Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT43Q96FT9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT43Q96FT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms