Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3CQ96E17 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms