Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A6EQ96DS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms