Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL29Q96CT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms