Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM143Q96AN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM143Q96AN5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms