Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC17Q96AE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms