Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX21Q969T3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX21Q969T3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms