Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEIL2Q969S2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL2Q969S2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms