Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LPGAT1Q92604 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPGAT1Q92604 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms