Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF3Q92576 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF3Q92576 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms