Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BAP1Q92560 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms