Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCSTNQ92542 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCSTNQ92542 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms