Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE1Q8WV22 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms