Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2BQ8WUD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms