Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDI1Q8WTU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDI1Q8WTU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDI1Q8WTU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms