Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms