Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH3RF3Q8TEJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF3Q8TEJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF3Q8TEJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF3Q8TEJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms