Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP1Q8TDR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms