Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT8

SPPL2A, Signal peptide peptidase-like 2A, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2AQ8TCT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPPL2AQ8TCT8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPPL2AQ8TCT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPPL2AQ8TCT8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms