Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDM1Q8TC05 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM1Q8TC05 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms