Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RP9Q8TA86 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms