Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVIPQ8NHG7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVIPQ8NHG7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms