Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOF1Q8ND07 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBOF1Q8ND07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms