Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87AQ8NBN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms