Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL23Q8NBE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms