Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTD1Q8N815 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD1Q8N815 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms