Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAF1Q8N7H5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAF1Q8N7H5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms