Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5AQ8N6Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms