Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSGALNACT2Q8N6G5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSGALNACT2Q8N6G5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms