Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN19Q8N6F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN19Q8N6F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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