Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFRP1Q8N474 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms