Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML4Q8N228 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML4Q8N228 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms