Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8AQ8IWT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8AQ8IWT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC8AQ8IWT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms