Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK2Q8IWQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BRSK2Q8IWQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms