Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA5

SLC44A2, Choline transporter-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A2Q8IWA5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC44A2Q8IWA5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A2Q8IWA5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A2Q8IWA5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A2Q8IWA5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A2Q8IWA5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A2Q8IWA5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A2Q8IWA5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms