Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC103Q8IW40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms