Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A9Q8IVB4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A9Q8IVB4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms