Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMB4Q86W47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMB4Q86W47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMB4Q86W47 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms