Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGMS1Q86VZ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms