Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD163Q86VB7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD163Q86VB7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms