Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMC1Q7Z7K0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMC1Q7Z7K0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMC1Q7Z7K0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms