Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APTXQ7Z2E3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APTXQ7Z2E3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms