Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOP1Q7RTM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms