Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT2Q7L5N7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms