Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SMIM5Q71RC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMIM5Q71RC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMIM5Q71RC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMIM5Q71RC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms