Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP43Q70EL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP43Q70EL4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP43Q70EL4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP43Q70EL4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP43Q70EL4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
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