Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS12Q6ZW61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBS12Q6ZW61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms